탠덤 질량 분석법

이온화 방식과 구별한다

MS/MS는 ESI나 전자 이온화처럼 처음 이온을 만드는 방식의 이름이 아니다. 이미 생성한 이온을 선택하고 반응 또는 분해를 거친 뒤 다시 분석하는 방법이다. 따라서 어떤 이온화 방식을 사용했는지와 MS/MS를 수행했는지는 별개의 실험 조건이다.

두 단계의 분석

대표적인 구성에서는 첫 분석부가 관심 있는 전구체 이온을 선택하고, 중간 충돌 셀을 지난 뒤 두 번째 분석부가 생성 이온을 조사한다. 사중극자와 TOF를 조합한 장치처럼 서로 다른 분석 원리를 연결할 수도 있다. 두 단계라고 해서 반드시 같은 종류의 분석기만 사용해야 하는 것은 아니다.

전체 이온에서 관계 정보로

단일 스펙트럼의 피크 위치를 보는 것에 더해, 선택한 이온에서 어떤 생성 이온이 나오는지 살펴볼 수 있다. 이는 이온들 사이의 관계에 관한 정보다. 분해 전후의 연결을 보지 않고 모든 피크를 서로 무관한 성분으로 세면 구조 해석의 중요한 단서를 놓친다.

구조 해석의 범위

복잡한 분자의 부분 구조나 펩타이드 서열을 조사하는 데 MS/MS를 활용할 수 있다. 하지만 생성 이온이 보였다는 이유만으로 모든 구조가 유일하게 확정되는 것은 아니다. 전구체 선택 조건과 분해 방식, 생성 이온의 해석을 함께 검토해야 결론의 범위를 정할 수 있다.