선을 세는 간단한 경우
루이스 구조에서 선 하나는 공유 전자쌍 하나를 뜻한다. 그래서 두 원자 사이에 선을 둘 그린 이중 결합은 결합 차수 2로 나타낸다. 분자 전체의 선을 모두 더하는 것이 아니라 지정한 두 원자 사이의 결합을 살핀다.
정수가 아닌 값
결합을 여러 구조의 기여로 설명하거나 분자 궤도 이론으로 다루면 정수가 아닌 결합 차수를 얻을 수 있다. 이런 값은 원자 사이에 전자쌍의 일부만 물리적으로 잘라 놓았다는 의미가 아니다. 모형에서 전자의 분포와 결합 성격을 나타내는 수치다.
정의와 계산 방법
전자 밀도를 원자와 결합 영역에 나누어 배정하는 방식은 하나만 있는 것이 아니다. 따라서 결합 차수의 숫자를 비교할 때에는 어떤 이론과 계산 방법을 사용했는지 확인해야 한다. 정의가 다른 값들을 같은 측정량처럼 바로 대조하지 않는다.
형식 전하와 구별
결합 차수는 두 원자 사이의 연결을 설명하고 형식 전하는 각 원자에 전자를 배정한 결과를 나타낸다. 이중 결합이 있다는 사실만으로 그 원자의 형식 전하가 +2나 −2라고 정해지는 것은 아니다. 결합 전자와 비결합 전자를 함께 세어 구분한다.